財政部關務署表示，在通關自動化便捷措施下，有高達8成以上的進口報單在通關時可C1通關免審免驗，致不肖業者藉此逃漏稅費。海關近期強化事後稽核的查核工作，查獲某食品大廠進口食用動物產品時，以高價低報方式規避關稅及營業稅，遭海關補稅及罰鍰近新臺幣1,300萬元，得不償失。
海關的事後稽核制度，係從已通關放行的案件中選案查核，在貨物放行翌日起6個月以書面通知被稽核人，提供與進出口貨物相關資料，實施事後稽核，若查獲違法情事，其查核範疇尚可回溯5年。
舉例說明，上述廠商於103及104年度進口多筆動物產品，經海關實施事後稽核結果，發覺被稽核人有22筆報單涉繳驗不實發票，虛報貨價，逃漏稅費，違反海關緝私條例第37條及44條規定，爰依法查核該廠商5年內另10筆進口報單，亦涉短報進口完稅價格，應追徵其所漏或沖退之稅款，將再補徵進口稅費近新臺幣270萬元。
海關自民國91年起啟動事後稽核制度，在通關便捷化措施下，查驗比率甚低，事後稽核制度益增其重要性。該署近期推動改進海關事後稽核制度，除全面性更新價格資料庫之外，也將針對不同產業別加強年度選案查核，同時著重培育人才，強化事後稽核人力配置，呼籲進口業者勿心存僥倖，應誠實申報，以免受罰。