自105年1月1日起，實施房地合一課徵所得稅制度，個人交易房屋、土地如符合房地合一課稅範圍，不論盈虧，原則上皆應於房地所有權移轉登記日之次日起算30日內完成房地合一稅之申報。惟如交易之房地屬未辦保存登記之房屋(例如違章建築)，因無法至地政機關辦理產權移轉登記，則應於訂定買賣契約日之次日起算30日內申報(如附表)，如漏未申報，將遭補稅處罰。
【舉例說明】甲君在106年2月買入一棟未辦保存登記的房屋，旋於同年度8月出售，依規定應於訂定買賣契約書之次日起30日內申報房地合一稅。惟因該房屋沒有辦理保存登記，因此交易過程中也無需辦理所有權移轉登記，甲君誤以為不必登記就無須辦理申報，經該局以成交價額減除成本費用，計算房屋交易所得77萬元，因持有期間在1年以內，適用稅率45%，核定應補徵稅額34萬6,500元，並處以罰鍰17萬3,250元。
房地合一稅是依據房地持有期間長短適用不同稅率課稅，所謂持有期間就是「取得日」至「出售日」的期間，原則上，出售日及取得日是以所有權移轉登記日來認定，至於例外之情形，例如經法院強制執行拍賣移轉房地、交易違章建築等無法辦理所有權登記的房屋，或是以設定地上權方式交易房屋使用權，則分別以拍定人領得權利移轉證書之日、訂定買賣契約之日及權利移轉之日來認定。民眾若發現自己有出售符合房地合一課稅範圍之房地而未辦理申報情形，在未經檢舉及未經稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查前，請儘速自動補報及加計利息補繳應納稅款，即可免受處罰。