納稅義務人應於每年5月1日起至5月31日止，辦理上一年度綜合所得稅結算申報，如未於申報期截止前完成申報，須在未經檢舉、未經稽徵機關或財政部指定人員進行調查前，自動補報繳稅款，才可以免罰。
今年受嚴重特殊傳染性肺炎(COVID-19)疫情影響，108年度綜合所得稅結算申報及繳納期限展延至109年6月30日截止，如納稅義務人因工作忙碌或一時疏忽，致未能如期辦理結算申報，在未經檢舉、未經稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查、未經公告之調查基準日前，向戶籍所在地國稅局補辦申報並補繳稅款，都可適用稅捐稽徵法第48條之1規定，加計利息免予處罰。
【舉例說明】甲君於107年度有執行業務及薪資等所得，未於申報期限(108年5月31日)前辦理綜合所得稅結算申報，以公告方式其未申報案件之調查基準日為109年4月1日，核定應納稅額3萬餘元，並處罰鍰1萬餘元。甲君不服申請復查，主張其於109年6月20日至戶籍地稽徵機關補申報並補繳稅款，並於同年7月1日收到核定通知書，應免處罰。經該局調查，甲君未於該年度綜合所得稅申報期限內辦理申報，稽徵機關以對外公告方式公告其案件之調查基準日為109年4月1日，雖然甲君有自動補報及補繳稅款，惟補報繳日期係於公告調查基準日後所為，尚無稅捐稽徵法第48條之1第1項免予處罰規定之適用。
納稅義務人未於法定期間內申報綜合所得稅或有短漏報所得者，請儘速向戶籍地國稅局辦理補報補繳稅款事宜，以免嗣後經稽徵機關查獲未申報或短漏報應課稅之所得者，除補稅外還須依所得稅法處以罰鍰。