證券投資信託及顧問法第4條第2項規定之證券投資顧問事業，自108年7月1日起，適用加值型及非加值型營業稅法（以下簡稱營業稅法）第11條第1項所定證券業之營業稅稅率2%。
經營證券投資顧問事業之營業人自108年7月1日起，應依營業稅法第4章第2節規定計算稅額。自108年9月1日起申報所屬年月份為108年7-8月以後各期之營業稅，應使用專營特種稅額計算營業人使用之「營業人銷售額與稅額申報書（404）」，其取得之進項憑證不得申報扣抵銷項稅額。
證券投資顧問事業依統一發票使用辦法第4條第25款規定，得免用或免開統一發票，如欲開立統一發票，應使用「特種統一發票」，將銷售額填載於金額欄，並依「專屬本業收入」或「非專屬本業收入」適用之稅率報繳營業稅。
證券投資顧問事業經營專屬本業(包括證券投資顧問業務、全權委託投資業務及其他經主管機關核准之有關業務)之銷售額，始有2%營業稅稅率之適用，如有其他非專屬本業之銷售額，仍應依營業稅法第11條第1項第1款規定按5%稅率課徵營業稅。