獨資組織營利事業對外雖以所經營之商號名義營業，實際上仍屬個人之事業，應以該獨資經營之自然人為權利義務之主體；另合夥組織依民法第667條及第668條規定，為2人以上互約出資以經營共同事業之契約，合夥財產為全體合夥人公同共有，合夥組織之權利義務為合夥人全體。是以，獨資商號變更合夥型態前之違章，經稽徵機關查獲，仍以變更前獨資經營之自然人為論處對象。
【舉例說明】
某甲於101年3月間設立獨資商號從事網際網路拍賣及服裝零售，於104年12月加入合夥人共同經營服飾業務，於102年至105年間購進貨物1億餘元，涉嫌未依規定取得進項憑證，嗣後被查獲，由於甲君獨資商號已變更為合夥商號，因二者權利義務歸屬不同主體，故應就個別經營期間未依規定取具進項憑證之違章行為，分別依稅捐稽徵法第44條規定論處。
進一步說明，獨資商號變更為合夥組織，如於變更前有觸犯稅法上之違章事實應受處罰時，究應以變更前抑或以變更後之商號或負責人為處罰對象，依案例甲君一人獨資商號變更為合夥組織，應視甲君獨資商號已結束，另成立同名合夥商號，故縱對外經營商號名稱相同，只要違章行為發生在變更為合夥組織之前，國稅局仍會究責獨資期間負責人，並不會因商號組織型態變更而併同處罰變更後之合夥商號。