營業人於法定申報期限前，若被查獲漏開或短開統一發票，除了處罰鍰外，最重將受停止營業的處分。

依據加值型及非加值型營業稅法第52條規定，營業人漏開統一發票或於統一發票上短開銷售額，於法定申報期限前經查獲者，應就短漏開銷售額按規定稅率計算稅額繳納稅款，並按該稅額處5倍以下罰鍰，但處罰金額不得超過新臺幣100萬元。營業人有前項情形，1年內經查獲達3次者，並停止其營業。

上開「1年內」係指自首次查獲之日起，至次年當日之前1日止。例如某營業人分別於106年6月5日、11月10日及107年3月30日被查獲漏開統一發票，因符合自106年6月5日起算至107年6月4日之「1年內」經查獲漏開統一發票達3次，稽徵機關應停止其營業，其期限為7天至14天。若該營業人第1次受停止營業處分後，再被查獲短漏開統一發票，例如前例營業人107年7月1日再度被查獲，且符合1年內（自106年11月10日起算至107年11月9日）經查獲3次（自106年11月10日、107年3月30日、107年7月1日），依「稽徵機關辦理營業人違反營業稅法停止營業處分作業要點」規定，該營業人於同1年度將被核處第2次停止營業處分，其期限為14天至28天。


營業人銷售貨物或勞務時，應依營業人開立銷售憑證時限表規定之時限，開立統一發票交付買受人，如有未依規定時限開立統一發票者，在經檢舉及稽徵機關調查前，於同一申報期限內自動補開，且於規定申報期限前申報者，適用稅捐稽徵法第48條之1規定，免予處罰。