依營利事業所得稅查核準則第101條之1規定，商品或原料、物料、在製品等因過期、變質、破損或因呆滯而無法出售、加工製造等因素而報廢者，除可依會計師查核簽證報告或年度所得稅查核簽證報告，並檢附相關資料核實認定其報廢損失者外，應於事實發生後30日內檢具清單報請該管稽徵機關派員勘查監毀，或事業主管機關監毀並取具證明文件，核實認定損失。
【舉例說明】甲公司最近因疫情關係，配合政府政策暫停營業，致有些存貨因過期、變質、破損或因呆滯而無法使用或出售，其報廢損失，除可請會計師查核簽證外，亦可出具事業主管機關監毀之證明文件，或於事實發生後30日內檢附報廢商品清單報請稽徵機關派員勘查監毀；但為簡化作業流程，申請報廢金額在新臺幣(下同)500萬元以下者，可以檢附原物料、商品變質報廢申請書等相關資料，經稽徵機關審核無異常，會通知營利事業補送銷毀過程前後之照片（須加註日期）備查，免實地勘。相關規定彙整如附件。
營利事業若申請商品報廢時，有廢品出售收入，應列為其他收入或商品報廢損失之減項，亦請留意相關法令規定，以免所列之費用或損失不符合稅法規定而無法認列。