依加值型及非加值型營業稅法(下稱營業稅法)第35條規定，使用統一發票營業人不論有無銷售額，應以每2月或每月為1期，於次期開始15日內，填具規定格式之申報書，檢附退抵稅款及其他有關文件，向主管稽徵機關申報銷售額、應納或溢付營業稅額，其有應納營業稅額者，應先向公庫繳納後，檢同繳納收據一併申報。營業人因受嚴重特殊傳染性肺炎疫情影響財務資金調度，致無法繳清應納之營業稅額，得於規定繳納期限內向稽徵機關申請延期或分期繳納稅捐，切勿自行以短報方式繳納部分稅款。
財政部為協助納稅人因受疫情影響，致繳納稅款確有困難，須申請延期或分期繳納稅款，訂定「稅捐稽徵機關受理納稅義務人因嚴重特殊傳染肺炎（COVID-19）疫情影響申請延期或分期繳納稅捐審核原則」，營業人只要檢具相關證明文件（詳附表），稽徵機關將從寬認定。惟近來發現有部分企業因營業收入驟減，無法於上揭規定期限內繳納應納之營業稅額，僅先行申報繳納部分銷售額及營業稅額，嗣後遭機關查獲，除補徵所漏稅款外另遭處罰。
【舉例說明】甲公司經營小汽車租賃業，營業收入受疫情影響而減少，109年11-12月營業稅應納稅額合計新臺幣（下同）1千1百萬餘元，因無力繳納全部稅款，遂於110年1月14日以現有資金先行申報部分銷售額8百萬餘元，繳納營業稅額40萬餘元，嗣後經查獲，以該公司當期短、漏報繳銷售額2億餘元及應納稅額1千60萬餘元，除補徵其所漏稅額1千60萬餘元外，另依營業稅法第51條第1項第3款規定，處以罰鍰1千60萬餘元。
營業人若因疫情影響，繳納稅款有困難者，應於繳納期限內向所轄稽徵機關申請延期或分期繳納，避免因短漏報繳稅款而遭處罰。