邇來查獲多起臺灣地區人民領取大陸地區高額薪資所得，漏未併同臺灣地區來源所得申報綜合所得稅，遭該局補稅裁罰案件，時值109年度綜合所得稅申報期間，該局特別提醒民眾留意，避免犯相同錯誤。
依臺灣地區與大陸地區人民關係條例第24條第1項規定，臺灣地區人民有大陸地區來源所得，應併同臺灣地區來源所得課徵所得稅。在大陸地區已繳納之稅額，如檢具經行政院設立或指定之機構或民間團體(目前為財團法人海峽交流基金會)驗證之納稅憑證，得於規定限額內自應納稅額中扣抵。
【舉例說明】甲君為臺灣地區人民，108年度經由仲介公司引介任職於大陸地區之A公司，甲君為A公司提供勞務並領取薪資合計美金20萬元，惟未依規定申報綜合所得稅，經該局查獲才向該局陳述其因不熟悉相關規定，誤認前開所得屬海外所得，乃漏未申報綜合所得稅，且因未達670萬元亦不需申報所得基本稅額。該局依前揭規定，將甲君取自大陸地區薪資所得併入臺灣地區來源所得課徵其個人108年度綜合所得稅，除補徵所漏稅額外，並依所得稅法第110條規定處以罰鍰。
甲君大陸地區所得倘於大陸地區繳納所得稅，其大陸地區納稅憑證先取得大陸地區公證處所核發之公證書，再送財團法人海峽交流基金會驗證，再向該局申請於規定限額內自其108年度綜合所得稅應納稅額中扣抵，以減少應納稅額及應處罰鍰。
臺灣地區人民109年度如有取自大陸地區來源所得，務必併同臺灣地區來源所得申報109年度綜合所得稅。以前年度如有取自大陸地區來源所得而漏未申報當年度綜合所得稅，凡屬未經檢舉、未經稅捐稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查之案件，得自動向稅捐稽徵機關補報並補繳所漏稅額及應加計之利息，可依稅捐稽徵法第48條之1規定免罰。