扣繳義務人於109年度若有給付應扣繳稅款之所得，及給付其他所得、未達起扣點或不屬所得稅法規定之扣繳範圍，而未經扣繳稅款者，應於110年2月1日（110年1月31日為星期日，順延至2月1日）前完成扣繳暨免扣繳憑單申報，將受領人姓名、住址、國民身分證統一編號及全年給付金額等，依規定格式，列單申報主管稽徵機關，完成申報程序。
扣繳制度是國家為掌握稅收來源及課稅資料，以達確保國庫收入及租稅公平之重要手段，因此所得稅法明定，扣繳義務人負有扣取、繳納稅款及申報扣繳憑單之義務，如扣繳義務人已扣繳稅款，惟未依限申報，應處以行為罰。
【舉例說明】甲君為A國民小學之責應扣繳單位主管，即所得稅法規定之扣繳義務人，其107年度給付B建築師事務所執行業務報酬時，雖已扣繳稅款並向國庫繳清，卻未於108年1月31日前完成扣繳暨免扣繳憑單申報，至108年5月31日始自動補報，經稽徵機關裁處罰鍰。甲君不服，主張因公務繁忙，漏未申報，應予免罰云云，申請復查。該局以甲君既為該校之責應扣繳單位主管，本應盡其注意能力，履行依限申報扣繳憑單之法定作為義務，卻未依限辦理申報，核有過失，遂予以復查駁回。
辦理所得稅扣繳時，切記「扣」、「繳」、「報」之步驟，亦即除扣取稅款、向國庫繳納外，仍需依限於次年1月底前據實填報扣（免）繳憑單，以免受罰。另若給付之所得人為非中華民國境內營利事業或個人，應於代扣稅款之日起10日內向國庫繳清扣繳稅款及據實填報扣繳憑單。