依臺灣地區與大陸地區人民關係條例第24條第1項規定，營利事業取得大陸地區支付之收入，應併同臺灣地區來源所得課徵所得稅。但為消除重複課稅，其在大陸地區已繳納之稅額，准自應納之營利事業所得稅額中扣抵，另為避免大陸地區所得稅稅率高，稅額扣抵措施侵蝕其他來源所得之稅收，同法條第3項規定扣抵限額，即大陸地區已納稅額得扣抵臺灣地區應納稅額之數額，不得超過因加計大陸地區來源所得，而依臺灣地區適用稅率計算增加之應納稅額。又所謂「所得」，依據所得稅法第24條第1項前段揭示之收入與成本費用配合原則，收入減除成本、費用或損失等，始為所得額。
【舉例說明】甲公司106年度取得大陸地區支付之技術服務收入1,280萬元，列報扣抵在大陸地區已繳納稅額130萬元，經該局以甲公司於計算稅額扣抵限額時，未減除取得該項收入之相關成本790萬元，重行計算因加計大陸地區所得而增加之應納稅額為83萬元〔（1,280萬元－790萬元）×稅率17%〕，雖然甲公司在大陸地區繳納稅額為130萬元，惟超過可扣抵稅額限額83萬元，僅得扣抵83萬元而核定補稅47萬元。
營利事業如有取自大陸地區支付之收入，除應併入當年度營利事業所得稅申報外，並應以取得大陸地區來源收入減除相關成本、費用或損失後之金額計算可扣抵稅額限額，始符合規定。