為提供更完善周延的營業稅網路申報服務，財政部於109年4月28日起提供新版營業稅網路申報繳稅系統(BLR 10900.01版)，新版程式重要修正功能如下：
1.新增營業人購買發票匯入與匯出功能。
2.審核與匯入介面操作選項記憶功能。
3.申報書收執聯/繳納書列印功能，新增「另存PDF」檔案可選擇是否要設定密碼。
4.因嚴重特殊傳染性肺炎影響申請延期或分期繳納功能。

營業人於109年5月申報同年3-4月營業稅時，務必上網下載新版程式，新版程式（版本BLR 10900.01）已公布在財政部電子申報繳稅服務網站【https：//tax.nat.gov.tw】提供下載，另安裝新版程式時不須移除原有程式，安裝時僅更新程式，並不影響已登錄的資料。