108年度綜合所得稅結算申報自109年5月1日起至同年6月30日止，為使納稅義務人順利完成申報，該局提醒相關重要規定及應注意事項如下：
一、免稅額、扣除額(詳附表說明)。
二、稅率級距(詳附表說明)。
三、個人獲配公司、合作社或其他法人以其87年度或以後年度盈餘所分配的股利或盈餘，應就下列方式擇一課稅：
(一)合併計稅：全戶股利及盈餘併入綜合所得總額課稅，並按全戶股利及盈餘合計金額的8.5%計算可抵減稅額，抵減應納稅額，每戶可抵減金額以8萬元為限。
(二)分開計稅：無論納稅義務人或配偶的各類所得採合併或分開計算稅額，全戶股利及盈餘不計入綜合所得總額，以全戶股利及盈餘合計金額按28%單一稅率分開計算稅額，再與其他類別所得的應納稅額加總，計算應繳(退)稅額。
四、考量全民健康保險屬強制性的社會保險，民眾繳納的健保費關係其個人就醫權益，故以被保險人眷屬身分投保者，無論與被保險人是否為同一申報戶，其健保費都可由納稅義務人申報扣除；【舉例說明】甲君以其配偶乙君（被保險人）的眷屬身分投保全民健保，乙君辦理綜合所得稅結算申報時並未與甲君合併申報，甲君由其子丙君列報為扶養親屬，雖甲君的健保依附於乙君，但甲君的健保費仍得由丙君於申報綜合所得稅時列舉扣除，且不受金額限制。
綜合所得稅一般扣除額分為標準扣除額及列舉扣除額，納稅義務人可選擇扣除金額較大者列報較為有利；惟經選定採標準扣除額(含稅額試算確認)、或未辦理結算申報、或申報時未採用列舉扣除額亦未填明適用標準扣除額，經稽徵機關按標準扣除額核定後，不得要求變更適用列舉扣除額。