納稅義務人至醫院做健康檢查所支付之健檢費用，必須與「醫療行為」具直接關連性，方能列報為個人綜合所得稅的醫藥費列舉扣除額。
所得稅法第17條第1項第2款第2目之3有關「醫藥費」列舉扣除額之立法意旨，係針對身體病痛接受治療而支付的醫療費用，屬生活中必要支出，為保障維持基本生活所需，故於計算所得淨額時得准予列舉扣除。從而，符合所得稅法規定之醫療費用，係指以治療、矯正人體疾病、傷害、殘缺為目的，所為直接進行醫療所生之診察、診斷及治療費用，倘納稅義務人僅係為瞭解自己身體狀況，以預防為目的所為之健康檢查，與立法意旨尚有差別，即不得列報為醫藥費列舉扣除額。
【舉例說明】甲君經醫師診斷患有大腸激躁症症狀，須進行腸胃鏡檢查，甲君依醫囑所為之檢查費用，自得列報醫藥費扣除額。乙君因家族成員有腸胃癌症病史，自行至醫院做腸胃鏡檢查，進而發現罹患大腸癌，隨即接受治療，乙君依據該腸胃鏡檢查結果，進一步醫治，二者間具有直接關連性，其所支付的檢查費用，亦得列報醫藥費扣除額。丙君例行性至醫院做全身健康檢查，檢查結果非常健康，丙君所支付的健檢費用，即與醫療行為無關，尚不得列報醫藥費扣除額。
納稅義務人至醫院進行健康檢查，所支付的健檢費用，並非均可列報醫藥費扣除額，尚須判斷該健康檢查是否與醫療行為直接相關，始得列報醫藥費扣除額，