依證券交易稅條例規定，證券交易稅係向出賣有價證券人課徵，但由代徵人填具繳款書向國庫繳納，例如：經由證券承銷商或經紀商出賣所承銷或受託之有價證券，其證券交易稅代徵人為證券承銷商或經紀商，如果是持有人直接出讓有價證券與受讓人者，其代徵人為受讓證券人。因此，私人間買賣未上市(櫃)股票，應由有價證券受讓人於每次買賣交割當日，按每次交易成交價格3%0稅率代徵，並於代徵之次日，自行填具繳款書向國庫繳納，稅款繳納完成即完成代徵義務，不需要向稽徵機關申報。
為便利代徵人計算證券交易稅款，財政部稅務入口網提供代徵稅額計算服務，代徵人可至財政部稅務入口網(etax.nat.gov.tw) /線上服務/電子申報繳稅服務/自繳繳款書三段式條碼列印(線上版)/證券交易稅一般代徵稅額繳款書—492，輸入證券出賣人、買受人、交易股數、成交總價格等資料，系統自動計算出應代徵稅額，正確又便捷。