關於中國時報7日電子報有關臺北市政府強烈反對廢止印花稅，質疑該政策嚴重衝擊地方財政，財政部說明如下：
一、我國現行對「銀錢收據」、「買賣動產契據」、「承攬契據」及「典賣、讓受及分割不動產契據」4種憑證課徵印花稅。鑑於承攬契據係由立據人依契約金額繳納1‰印花稅，倘營業人承攬交易屬銷售勞務性質者，尚應就銷售額開立統一發票報繳5%營業稅，二稅稅基及課稅要件不同，亦非必然同時課徵，惟均係以同一交易之承攬金額計算稅額，致民眾有重複課稅之感；印花稅課稅憑證之認定，係以性質為準，不以名稱為據，然實務就憑證屬應按金額繳納印花稅之銀錢收據，或免納印花稅之核對數目用帳單迭存爭議；訂貨單具承攬契據適用1‰稅率或買賣動產契據應納12元印花稅，亦常為徵納雙方爭執。
二、查74年制定新制營業稅時，將附隨營業發票課徵之印花稅納入營業稅課徵，並規劃長期將視稅收情況適時廢止印花稅；91年行政院財政改革委員會「印花稅及娛樂稅之檢討」報告，建議可調升營業稅稅率以彌補地方政府財源之原則下，廢除印花稅；98年行政院賦稅改革委員會「綠色稅制之研究」報告，建議綠色稅制改革將產生充裕稅收，藉此改良印花稅。
三、依據財政收支劃分法第12條第1項規定，印花稅屬100%直轄市及縣(市)政府收入；次按同法第38條之1及財政紀律法第5條規定，各級政府、立法機關制(訂)定或修正法律或自治法規，有減少歲入者，應同時籌妥替代財源，具體指明彌補資金之來源。為避免影響地方施政，財政部將在兼顧財政餘裕及財政紀律情形下，配合法制作業時程，擬具廢止「印花稅法」說明，報請行政院核轉立法院審議，並洽商行政院主計總處籌劃地方稅收損失替代財源以為因應。