107年2月7日修正公布所得稅法第42條，刪除第2項有關教育、文化、公益、慈善機關或團體(以下簡稱機關團體)獲配國內股利或盈餘不計入所得額課稅規定，請機關團體於今(108)年5月份辦理107年度結算申報時，應注意將107年度獲配之股利或盈餘計入所得額，並依所得稅法及教育文化公益慈善機關或團體免納所得稅適用標準(以下簡稱免稅標準)規定徵、免所得稅。
機關團體銷售貨物或勞務之所得，應依法課徵所得稅，如機關團體銷售貨物或勞務以外之收入不足支應與其創設目的有關活動之支出(以下簡稱不足支應數)時，銷售貨物或勞務之所得可以將不足支應數扣除，如有餘額，始予課稅。
進一步說明，機關團體在計算不足支應數時，如有獲配之股利或盈餘，依修法前所得稅法第42條規定，可自銷售貨物或勞務以外之收入中減除，但自107年1月1日起，不得自銷售貨物或勞務以外之收入中減除，因此，得自銷售貨物或勞務所得扣除之不足支應數將減少，請機關團體於申報時特別注意。
【舉例說明】
甲基金會107年度申報銷售貨物或勞務之所得400萬元，銷售貨物或勞務以外之收入500萬元(含股利收入300萬元)，與創設目的有關活動之支出600萬元，107年度課稅所得額應如何計算？特別提醒計算不足支應數時，注意股利收入300萬元不能自銷售貨物或勞務以外之收入中減除，是以銷售貨物或勞務以外收入應為500萬元，減除與創設目的有關支出600萬元，不足支應數為100萬元（500萬元－600萬元），銷售貨物或勞務之所得400萬元，扣除不足支應數100萬元，課稅所得額為300萬元（400萬元－100萬元）(詳附表)。
特別提醒，所得稅法第42條刪除機關團體獲配股利或盈餘不計入所得額之規定後，機關團體獲配股利或盈餘已非屬當然之免稅收入，自107年度起應計入其銷售貨物或勞務以外之收入，以正確計算得自其銷售貨物或勞務之所得中減除之不足支應數，並依所得稅法及免稅標準規定徵、免所得稅。