納稅義務人若對復查決定不服提起訴願，依訴願法第56條第1項及第58條第1項規定，應於法定期間內繕具訴願書載明相關資料，經由原行政處分機關(即各地區國稅局)向訴願管轄機關(即財政部)提起。若以郵寄訴願書方式辦理，受理日期依同法第14條第3項規定，以原行政處分機關或受理訴願機關收受訴願書之日期為準。
【舉例說明】
居住新北市之甲君於106年11月6日接獲復查決定書，其向財政部提起訴願，期間應自106年11月7日起算30日，依行政院訂定之訴願扣除在途期間辦法規定，在途期間為2日，其至遲應於106年12月8日送達訴願書由財政部收受(即蓋收文章)，惟甲君於106年12月13日才將訴願書送達財政部，因已超過法定期間，經財政部訴願決定不受理。
特別提醒，基於「程序不合，實體不究」原則，納稅義務人對於復查決定如有不服，務必注意在法定救濟期間內申請訴願，以維護自身權益。