納稅義務人依所得稅法第71條規定應辦理結算申報而未辦理(含未完成結算申報程序)，經稽徵機關核定應納稅額者，不適用同法第17條第1項第2款第2目列舉扣除額之規定。
【舉例說明】
甲君105年度有薪資所得合計827,500元，已超過當年度規定免稅額及標準扣除額之合計數，未辦理綜合所得稅結算申報，經該局查獲，按標準扣除額減除90,000元，核定綜合所得淨額269,500元，補徵應納稅額13,475元。甲君不服，主張為何沒有扣除其所支付之購屋借款利息205,811元，逕行核定應納稅額云云，申請復查。該局以甲君未依規定辦理105年度綜合所得稅結算申報，且未於該局核定補徵應納稅額前自動補報，依所得稅法第17條第3項規定，無列舉扣除額之適用，經復查駁回確定。
特此提醒納稅義務人注意，綜合所得稅係採自行申報制，納稅義務人如欲列舉扣除自用住宅購屋借款利息，即應依所得稅法第71條規定自行辦理綜合所得稅結算申報，方得以綜合所得總額，減除免稅額及各項列舉扣除額計算應納稅額，以維護自身權益。