納稅義務人對於稅捐稽徵機關核定稅捐處分不服，如經復查、訴願或行政訴訟程序終結決定或判決確定，有應補繳稅款者，稅捐稽徵機關應依稅捐稽徵法第38條第3項規定，填發補繳稅款繳納通知書，通知納稅義務人繳納，該補繳稅款繳納通知書僅係補發性質，非行政處分，納稅義務人如依同法第35條規定申請復查，稅捐稽徵機關將以其程序不合法為由，予以復查駁回。
【舉例說明】
甲公司因103年度營利事業所得稅事件，於105年11月間申請復查，在復查審理中，甲公司具文向國稅局撤回復查，視同未申請復查已確定，國稅局遂依稅法規定，填發補繳稅款繳納通知書，通知納稅義務人繳納，甲公司在接獲補發之稅單後，再於該稅單繳納期限屆滿翌日起算30日內申請復查，經國稅局以甲公司第2次復查申請程序不合為由，予以駁回，甲公司不服，循序提起訴願及行政訴訟，經最高行政法院裁定駁回確定。
最高行政法院裁定意旨略以，查該繳款書僅是補發性質，此觀該繳款書之補徵稅額及罰鍰金額均與原處分內容相符即可知，顯見該繳款書僅係有關甲公司應於限繳日期內繳款之觀念通知，並非行政處分，不得為申請復查之客體。甲公司既然在程序上已不得再為行政爭訟，其實體法上之爭議，原審法院亦無審酌之必要，遂駁回甲公司之抗告。
進一步表示，稅捐稽徵法第35條規定之復查程序，對已確定之行政處分並不適用，惟如符合行政程序法第128條規定之要件，且未經行政法院實體判決確定之案件，納稅義務人可檢附相關證明文件，向原處分機關申請。