依所得稅法第17條第2項規定，應辦理結算申報而未辦理，經稽徵機關核定應納稅額者，不適用列舉扣除額之規定。所以，納稅義務人如未依規定辦理結算申報，經稽徵機關依查得資料核定其應納稅額案件，不能適用列舉扣除額，也就是說，稽徵機關將依標準扣除額方式核定。
【舉例說明】納稅義務人甲君，自行採用列舉扣除額試算後無應納稅款，以為不需要辦理結算申報而未申報，直到收到國稅局核定稅單，才主張採列舉扣除額，惟因未符合前揭規定，故不能適用列舉扣除。
納稅義務人如欲選用列舉扣除額，計算結果無論有無應納稅額，均應檢具相關證明文件辦理結算申報，以供稽徵機關核認，否則經國稅局查獲未辦理申報，除依法不能採用列舉扣除需補稅外，若未申報所得超過25萬元或漏稅金額超過1萬5千元者，將依所得稅法第110條第2項規定處以罰鍰。