依所得稅法第110條第3項規定，營利事業因受獎勵免稅或營業虧損，致加計短漏之所得額後仍無應納稅額者，應就短漏之所得額依當年度適用之營利事業所得稅稅率計算之金額，依規定倍數處罰。
【舉例說明】甲公司已辦理108年度營利事業所得稅結算申報，惟經他人檢舉虛報薪資所得扣（免）繳憑單，經稽徵機關調查後，甲公司無法提示該員工薪資給付及任職之相關證明資料，稽徵機關遂依查得資料認定其虛列薪資費用57萬元屬實，併同剔除虛列該員工之伙食費2萬元，合計剔除營業費用59萬元，雖甲公司當年度營利事業所得稅結算列報營業虧損100萬元，經減除該筆薪資費用及伙食費後，重行核定所得額為虧損41萬元，並無應納稅額，仍應就其短漏報所得額59萬元，按108年度營利事業所得稅稅率20%計算之金額，處2倍以下罰鍰，但最高不得超過9萬元，最低不得少於4千5百元。
於辦理營利事業所得稅結算申報時，應就帳載會計事項，依所得稅法等相關法令規定誠實申報，倘因疏失致發生短漏報課稅所得額情事，應儘速主動按正確資料向所轄稽徵機關辦理更正申報，並自動補繳應納稅額及加計利息，惟未經檢舉、未經稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查之案件，依稅捐稽徵法第48條之1規定，可免予處罰。