納稅義務人如未依所得稅法第71條規定辦理綜合所得稅結算申報，經稽徵機關核定應納稅額後，不得適用列舉扣除額。
納稅義務人辦理綜合所得稅結算申報時，得依所得稅法第17條第1項第2款規定，選擇採標準扣除額或列舉扣除額申報，依此，若其提出符合列舉扣除項目之實際支出單據（含納稅義務人本人、配偶及受扶養親屬之支出），合計超過標準扣除額者，自得選擇採用列舉扣除額辦理申報；惟依同法條第2項規定，如納稅義務人應辦理結算申報而未辦理，一經稽徵機關核定應納稅額者，即不得再選擇適用列舉扣除額之規定。
【舉例說明】納稅義務人甲君自行試算108年度綜合所得稅時，以列舉扣除額計算應納稅額，自認無需繳稅而未辦理當年度結算申報，嗣經國稅局以標準扣除額計算核定補稅。甲君申請復查始主張選擇採用列舉扣除額，甲君自始未依規定辦理結算申報，且已經稽徵機關核定在案為由，維持原核定。
納稅義務人如欲選擇採用列舉扣除額，無論計算結果有無應納稅額，均應依規定辦理結算申報，否則一旦經國稅局核定應納稅額後，即無法再選擇改採列舉扣除額。