醫師業者申報執行業務所得，列報醫療院所醫療用機器及設備之折舊費用，應以不短於7年之耐用年數，逐年平均提列。如於耐用年限屆滿仍繼續使用者，得預估可使用年數並重新估計殘值，續提折舊。
固定資產耐用年數表規定，醫療用之機器及設備耐用年數為7年，與生財器具耐用年數為5年之規定不同。再依執行業務所得查核辦法第30條規定，固定資產之折舊，應採用平均法，按不短於固定資產耐用年數表規定之耐用年數，逐年依折舊率提列；按短於規定耐用年數提列者，其超提折舊部分，不予認定；於耐用年限屆滿仍繼續使用者，得自行預估可使用年數並重新估計殘值後，按平均法計提折舊。每年折舊額、殘值及續提折舊額計算公式如下：
(一)每年折舊額=(固定資產之實際成本–殘值) ÷ 耐用年數
(二)殘值=固定資產之實際成本 ÷ (耐用年數＋1)
(三)續提折舊額=(原留殘值-重行估列殘值)÷估計尚可使用年數
【舉例說明】某診所107年度執行業務所得案件，發現該診所於104年1月購買醫療設備720萬元，誤以5年提列折舊費用120萬元〔720萬元 ÷ (5+1)年=120萬元〕，經依正確耐用年數7年計算，每年折舊額應為90萬元〔720萬元 ÷ (7+1)年=90萬元〕，剔除超限金額30萬元。
醫師業者申報執行業務所得，列報醫療設備折舊之提列年限及固定資產殘值之折舊，應注意上開規定，正確申報。