獨資組織營業人轉讓或變更負責人時，雖然營業稅稅籍沒有註銷，但原負責人將其存貨及固定資產轉讓與新負責人時，仍應視為銷售貨物依法課徵營業稅。
依加值型及非加值型營業稅法第3條第3項第2款及同法施行細則第19條規定，營業人解散或廢止營業時所餘存之貨物，應視為銷售貨物並按時價開立統一發票。獨資組織營業人對外雖仍以所經營之商號名義營業，實際上屬獨資出資人個人之事業，應以該獨資經營之自然人為權利義務主體。當獨資營業人之負責人變更，原負責人將存貨及固定資產轉讓與新負責人時，其權利義務已由原負責人移轉至新負責人，依上開規定，應按時價開立統一發票報繳營業稅。至受讓人取得該進項發票所支付之進項稅額，可申報扣抵銷項稅額。
【舉例說明】A獨資商號係使用統一發票之營業人，其負責人甲與受讓人乙簽訂讓渡契約，約定將該商號之經營權轉讓予乙，甲將其價值100萬元之存貨及固定資產移轉給乙時，視為銷售貨物，應以A商號名義開立銷售額為100萬元，稅額為5萬元之三聯式統一發票交付與受讓人乙(統一發票買受人欄仍記載為A商號)，並依法報繳營業稅，至受讓人乙取得該進項發票可申報扣抵銷項稅額。
獨資組織之營業人變更負責人時，應特別注意相關規定，以免因漏開統一發票而遭受處罰。