依有限合夥法設立登記之有限合夥，其會計帳冊簿據完備，虧損及申報扣除年度均使用所得稅法第77條所稱藍色申報書或經會計師查核簽證，並如期申報者，可比照公司組織之營利事業，適用所得稅法第39條第1項但書有關前10年虧損扣除之規定。
有限合夥係以營利為目的，並具有法人格之商業組織，屬於所得稅法第11條第2項規定其他組織方式成立之營利事業，亦須依所得稅法第71條及同法第66條之9規定辦理結算申報及未分配盈餘之課稅。依所得稅法第39條第1項但書規定，「公司組織」之營利事業，會計帳冊簿據完備，虧損及申報扣除年度均使用第77條所稱藍色申報書或經會計師查核簽證，並如期申報者，得將經該管稽徵機關核定之前10年各期虧損，自本期純益額中扣除後，再行核課，其立法意旨係避免以年度為期限計算營利事業之所得常使變動性大之所得負荷過重。基於租稅平等原則及課稅一致性，財政部108年5月16日台財稅字第10804535120號令釋，有限合夥符合首揭要件者，亦可比照公司組織適用所得稅法第39條第1項但書虧損扣除規定。

財政部已明確核釋符合要件之有限合夥得適用所得稅法第39條第1項但書前10年虧損扣除之規定，請有限合夥之營利事業留意相關規定，以維自身權益。