營利事業或教育、文化、公益、慈善機關或團體(下稱機關團體)如購買符合貨物稅條例第11條之1、第12條之5或第12條之6減徵貨物稅之貨物，於取得退還之貨物稅時，應將該退還稅額列為固定資產成本或當年度費用之減項。
營利事業或機關團體購買該等貨物如帳列固定資產，該退稅款應自該資產成本減除，按減除後之帳面金額計提折舊；該等貨物如帳列當年度費用，該退稅款則應作為當年度費用之減項。如於購買次年度才申請退稅者，該退稅款應於申請時列為該資產未折減餘額之減項，依所得稅法第52條規定計算折舊；該貨物業以費用列帳者，退稅款應列為申請年度之其他收入。
營利事業或機關團體購買符合上開貨物稅條例之新車或節能電器而取得退還之減徵貨物稅稅額，實質上為購買貨物成本或費用之減少，非屬所得性質，給付單位退還上開貨物稅稅額無須向主管稽徵機關申報免扣繳憑單 。