納稅義務人辦理綜合所得稅結算申報，列報退職所得時，應依扣繳單位所開立之扣繳憑單或查詢所得資料參考清單所載給付總額申報，勿再重複減除按服務年資計算免計入所得額之金額，以免造成短報退職所得而被處罰鍰情事。
所得稅法第14條第1項第9類規定之退職所得，係指個人領取之退休金、資遣費、退職金、離職金、終身俸、非屬保險給付之養老金及依勞工退休金條例規定辦理年金保險之保險給付等所得，並以領取總額減除按定額及退職服務年資計算之金額(一次領取)，或減除一定金額(分期領取)後之餘額為所得額。以108年度為例，一次領取退職所得額之計算方式為：（一）一次領取總額在18萬元乘以退職服務年資之金額以下者，所得額為零。（二）超過18萬元乘以退職服務年資之金額，未達36萬2千元乘以退職服務年資之金額部分，以其半數為所得額。（三）超過36萬2千元乘以退職服務年資之金額部分，全數為所得額。扣繳單位依據上述規定核算員工之退職所得，係以該員工所領取退職給付額減除定額免稅部分，據以填報為扣繳憑單之所得總額，故納稅義務人應依扣繳憑單給付總額列報退職所得，併入取得年度綜合所得總額申報繳納所得稅。
【舉例說明】甲君於證券公司任職服務20年，並於108年度退休，經證券公司核算甲君一次領取退職金1,600萬元，按甲君服務年資20年計算之定額免稅額為542萬元〔18萬元×20年＋(36萬2千萬元×20年－18萬元×20年)/2〕，是該證券公司就甲君應稅之退職所得開具給付總額1,058萬元（退職金1,600萬元－定額免稅額542萬元）之扣繳憑單，甲君於申報綜合所得稅時，應按照扣繳憑單之給付總額1,058萬元列報退職所得，不得再自行計算及減除定額免稅額。