員工於特別休假日因執行職務所領取的不休假獎金，屬加班費性質，其符合勞動基準法第38條規定之天數及同法第39條規定工資發給之標準範圍者，免計入員工薪資所得課稅。
依財政部74年5月29日台財稅第16713號函規定，機關、團體、公私營事業員工為雇主之目的，於特別休假日執行職務而支領之加班費，其金額符合勞動基準法規定標準範圍以內者，免納所得稅，其加班時數不計入勞動基準法第32條規定「每月平日延長工作總時數」。
【舉例說明】A公司員工甲君於該公司服務2年以上未滿3年，A公司依勞動基準法第38條規定，給予甲君10日特別休假日。截至108年底甲君已休8日，尚有2日未休，A公司因甲君於特別休假日2日執行職務所發給的不休假獎金5,000元，如符合勞動基準法規定標準範圍，得免列入甲君薪資所得計算。
扣繳單位如有將員工符合免稅規定的加班費，誤計入員工薪資所得總額申報扣繳憑單情事，應儘速向轄區國稅局辦理更正，以維員工權益。