營利事業出售採權益法之長期股權投資時，應依所得稅法第45條規定，以出價取得之原始投資成本作為出售資產損益之計算基礎，而非以長期股權投資之帳面餘額。
進一步說明，營利事業帳列採權益法認列之長期股權投資，依財務會計規定調整帳面餘額時，可能因非屬稅法規定之實際出價取得，而致出售該股權之投資成本產生財、稅差異，最常見有3種情形如下：
（1）依財務會計規定，被投資公司當年度發生之損益按持股比例調整長期股權投資之帳面價值。
（2）被投資公司發放現金股利，依財務會計規定須調減長期股權投資之帳面價值。
（3）被投資公司發放股票股利時，財務會計僅備註股數增加，惟稅法規定獲配之股數可按面額增加投資成本。所以，營利事業出售採權益法之長期股權投資時，應先調整財、稅差異後，重新計算出售成本，始能正確申報出售資產損益。
【舉例說明】
甲公司105年度營利事業所得稅申報出售資產損失0.5億元，經查核發現係出售採權益法之長期股權，甲公司原始投資成本3億元，認列投資收益1.3億元、獲配現金股利0.3億元、股票股利0.4億元，而甲公司逕以其帳面餘額4億元（原始投資成本3億＋投資收益1.3億－現金股利0.3億）作為投資成本計算基礎，惟依稅法規定核算之出售成本僅為3.4億元（原始投資成本3億+股票股利0.4億），致多計出售成本0.6億元，遭該局調整補稅。
特別提醒，營利事業出售採權益法之長期股權投資，計算出售損益時，應依稅法規定調整，以免申報錯誤而遭調整補稅，影響自身權益。