作業承包工程，如委託人依工程合約對承包人所為之罰款，承包人雖得以其尚未支付之工程尾款抵付罰款，惟仍應依「營業人開立銷售憑證時限表」之規定時限，於工程合約所載每期應收價款時之金額，開立統一發票並報繳營業稅。

【舉例說明】
甲公司承包乙公司工程，工程完工後尚有工程尾款500萬元未領，嗣因甲公司逾期完工被乙公司處罰款300萬，甲公司不得以工程尾款500萬元抵付逾期罰款300萬元，而僅開立200萬元之發票予乙公司，因甲公司被處罰款與依限開立發票係屬二事，甲公司仍應依規定時限，開立500萬元統一發票及報繳營業稅。

進一步提醒，營業人切勿自認工程款因違反工程合約抵付罰款，即可免除開立發票與報繳稅款之義務，以免遭補稅受罰，請特別注意。