財政部今(19)日發布解釋令，土地承租人於承租土地上自費興建房屋，以土地承租人為建造執照原始起造人取得使用執照，非屬契稅課稅範圍。惟以土地出租人為建造執照原始起造人取得使用執照，或依約於土地租賃期間屆滿後移轉房屋予土地出租人，其經濟實質係土地出租人以土地使用權取得房屋，依民法第398條「當事人雙方約定互相移轉金錢以外之財產權者，準用關於買賣之規定。」應按買賣契稅稅率申報納稅。同時，廢止該部86年12月27日台財稅第861932893號函。
依契稅條例第2條規定，不動產之買賣、承典、交換、贈與、分割或因占有而取得所有權者，均應申報繳納契稅。土地承租人於承租土地上自費興建房屋，以自己為起造人取得使用執照，非上開契稅規定之課稅範圍；土地出租人之土地租賃行為，無涉房屋買賣，亦非上開契稅規定之課稅範圍。惟倘土地出租人與承租人簽訂土地租賃契約，雙方約定由承租人於承租土地上自費興建房屋，以出租人為建造執照之原始起造人並取得使用執照，該租賃契約已非單純出租人提供土地使用權，而係另外約定以租賃期間土地使用權與承租人自費興建之房屋交換，形成土地租賃關係、土地使用權與房屋互易關係之混合契約(無名契約)。
基於私法自治原則及契約自由原則，混合契約當事人形成多個法律關係，宜予尊重，惟其法律關係倘構成契稅課稅要件(即土地使用權與房屋互易)，以土地出租人為建造執照原始起造人取得使用執照，即涉及契稅條例第12條第2項應由使用執照所載起造人申報納稅之情形，依前揭民法第398條規定，應按買賣契稅稅率申報納稅；此外，約定租期屆滿後移轉房屋予出租人之情形，同屬以土地使用權與房屋交換，亦應按買賣契稅稅率申報納稅。該部表示，類似上述混合契約之案況，前經行政法院判決確定有案(參照最高行政法院93年判字第971號判決、96年裁字第1481號裁定)，爰今(9/19)核釋上開情形，應按買賣契稅稅率申報納稅。
該部86年12月27日台財稅第861932893號函，係基於當時商港法法令之限制，因此核釋航商向高雄港務局承租土地，由航商出資於該土地上興建房屋，並以該局名義為房屋起造人及所有權人，非屬契稅條例第2條課稅範圍；100年12月28日修正後商港法，港務局已不存在，爰廢止本部86年函。
進一步說明，該部96年3月16日台財稅字第09604517910號令土地承租人租地自費建屋，房屋登記為土地出租人所有，出租人之租賃所得以營建總成本為租金收入之計算基礎，該房屋為出租土地之對價；惟依經濟實質係土地出租人以土地使用權取得房屋，應依契稅條例第2條及第12條規定，按買賣契稅稅率申報納稅，請納稅義務人依規定辦理申報。