自104年度起，非小規模之獨資合夥營利事業，辦理營利事業所得稅(決)結算申報時，應以其全年應納稅額之半數，減除尚未抵繳之扣繳稅額，計算其應納之結算稅額，於申報前自行繳納；其營利事業所得額減除全年應納稅額半數之餘額，應由獨資資本主或合夥組織合夥人依所得稅法第14條第1項第1類規定列為營利所得，依所得稅法規定課徵綜合所得稅。
【舉例說明】
獨資商號甲企業社，104年度辦理結算申報時，課稅所得額為1,000,000元，計算應納稅額為170,000元，當年度有尚未抵繳之扣繳稅額1,500元。甲企業社於105年5月辦理結算申報時，應先自行繳納83,500元[(170,000元÷2)-1,500元]之營利事業所得稅；另甲企業社之獨資資本主並應將915,000元[1,000,000元-1,500元-83,500元]之營利所得列入課徵個人綜合所得稅。
提醒非小規模之獨資合夥營利事業，應依前揭規定辦理104年度結(決)算申報，並於申報前自行繳納營利事業所得稅，以維自身權益。