營利事業申報之所得額雖達財政部頒訂之同業利潤標準，惟其申報異常，顯有匿報、短報或漏報所得額之情事，稅捐稽徵機關仍得依所得稅法及稅捐稽徵法之相關規定，調查課稅事實，予以補徵或裁罰。
【舉例說明】
甲公司辦理95年度營利事業所得稅結算申報，列報銷貨折讓2億餘萬元，經國稅局以其列報銷貨折讓較以往年度偏高，且提示之文件未載明相關銷貨折讓之原因、金額及方式等約定，或所提銷貨折讓之折扣率前後不一，又查得甲公司係事後協議調減當年度銷貨收入，乃遭國稅局剔除補稅。甲公司不服，主張其給與經銷商銷貨折讓後，毛利率乃高於財政部頒訂之同業利潤標準，國稅局逕予調整，顯侵害其營業自由等語，申經復查及提起訴願均遭駁回，遂提起行政訴訟，全案經臺北高等行政法院判決駁回而告確定。
進一步解釋，我國所得稅制係採申報制，其核心價值之一，即由納稅義務人秉持誠實精神主動申報完稅，故納稅義務人倘有匿報、短報或漏報等情事，則其偏離所得稅制之核心價值，為法所不許，稅捐稽徵機關仍得調查課稅事實予以補徵或裁罰。而銷貨折讓屬於銷貨收入之減除項目，係屬對營利事業有利之要件事實，自應由營利事業針對銷貨折讓之事實負客觀舉證責任，否則即應負擔不得認列之不利益結果。
特別提醒，營利事業申報之所得額雖達財政部頒訂之同業利潤標準，仍應負誠實申報之義務，以免遭補稅及處罰。