扣繳單位給付租金、權利金等各類所得時，若約定由扣繳單位負擔稅款，而以未含扣繳稅款的金額辦理扣繳，扣繳單位將因短扣稅款而受罰。
依所得稅法第88條規定，扣繳義務人於給付應扣繳範圍之各類所得時，應依規定之扣繳率或扣繳辦法扣取稅款，並依規定繳納之。如：國內營利事業給付國外公司權利金時，應於給付時自給付總額中扣取20%的稅款，再將淨額給付予國外公司；但契約若約定由國內營利事業負擔扣繳稅款，則須按國外公司實際取得的權利金報酬，加計其應負擔之扣繳稅款後之給付總額，作為計算扣繳稅款之基礎。
【舉例說明】
假設國內甲公司給付國外乙公司權利金，約定國外乙公司每次實收500萬元，則甲公司給付乙公司權利金，應以給付淨額500萬元換算給付總額為625萬元〔500萬元÷﹙1-20%﹚〕，再按給付總額625萬元乘以扣繳率﹙20%）計算扣繳稅款125萬元﹙625萬元×20%）。
扣繳單位於給付所得時，如稅款約定由扣繳單位負擔，請扣繳義務人務必注意扣繳稅款的計算方式，以免計算錯誤，造成短扣繳稅款而受罰。