自105年1月1日起買賣房地適用房地合一新制者，夫妻之一方於申報房地合一稅時，若符合「納稅義務人與配偶分居得各自辦理綜合所得稅結算申報及計算稅額之認定標準」第2條規定，於適用所得稅法第4條之5第1項第1款第3目有關交易前6年內未曾適用自住房屋、土地免納所得稅規定時，該個人與其配偶得個別認定。
王先生詢問:其與配偶分居數年，若未來出售房地適用房地合一新制，而配偶已於6年內經核定符合自住房地租稅優惠，於申報房地合一稅時，可否再申請適用該優惠?
依所得稅法第4條之5第1項第1款規定，房地合一稅之自住優惠，除需符合個人與其配偶、未成年子女辦竣戶籍登記、持有並居住於該房屋連續滿6年，且於交易前6年該房屋未有出租、供營業或執行業務使用外，個人與其配偶、未成年子女於交易前6年內未曾適用本款規定，惟依房地合一課徵所得稅申報作業要點第14點，個人與其配偶如因感情不睦或婚姻暴力等因素而有分居之情形，符合「納稅義務人與配偶分居得各自辦理綜合所得稅結算申報及計算稅額之認定標準」第2條規定得各自辦理綜合得稅結算申報及計算稅額條件者，得個別認定自住房屋、土地交易前6年未曾適用優惠規定之條件。
個人有符合房地合一稅課稅範圍之交易所得或損失，不論有無應納稅額，應於房屋、土地完成所有權移轉登記日之次日或所得稅法第4條之4第2項所訂房屋使用權交易日之次日起算30日內自行填具申報書，檢附契約書影本及其他有關文件，向該管稽徵機關辦理申報；其有應納稅額者，應一併檢附繳納收據。