依所得稅法第110條第3項規定，營利事業因受獎勵免稅或營業虧損，致加計短漏之所得額後仍無應納稅額者，應就短漏之所得額依當年度適用之營利事業所得稅稅率計算之金額，分別按已依規定或未依規定辦理結算申報之不同，處以2倍以下或3倍以下罰鍰，但最高不得超過90,000元，最低不得少於4,500元。
【舉例說明】
甲公司99年度營利事業所得稅結算申報，申報全年所得額為虧損1,200餘萬元，嗣遭人檢舉漏報其他收入，經國稅局調查後，認定其漏報其他收入2,400,000元，經加計該筆漏報之收入，全年所得額仍為虧損並無應納稅額，惟依前揭規定仍應處罰。因該公司已承認違章事實並願意繳清罰鍰，故依稅務違章案件裁罰金額或倍數參考表規定，就該公司短漏所得額240萬元，按當年度所漏稅額408,000元（2,400,000元×17%），處以0.4倍罰鍰計163,200元，但依規定最高不得超過90,000元，所以處以罰鍰90,000元。
特別提醒營利事業留意，所得稅法第110條第3項規定主要目的在維護誠實自動申報制度，確保善良納稅風氣，所以只要短漏報所得，經加計該短漏報所得後縱無應納稅額，仍屬違反自動申報義務而構成違章，依法仍會遭處罰。