納稅義務人辦理綜合所得稅結算申報，列報重購自用住宅扣抵稅額，應符合所得稅法相關法令規定，始得列報。
納稅義務人出售自用住宅房屋，於2年內重購自用住宅房屋，且重購房屋價額超過出售房屋，則納稅義務人得於重購自用住宅房屋完成移轉登記之年度，申請依所得稅法第17條之2規定扣抵或退還已納綜合所得稅，先購後售者亦可適用。又出售和重購之房屋均須為自用住宅，即納稅義務人或其配偶、同一申報戶受扶養直系親屬於該地辦竣戶籍登記，且於出售前1年內無出租或供營業使用之房屋。

【舉例說明】
納稅義務人甲君於101年度出售房屋價款300萬元，因出售該房屋所增加綜合所得稅款5萬元，並於102年度重購房屋價款500萬元，甲君配偶在103年度始於重購房屋遷入戶籍，甲君申報102年度綜合所得稅列報重購自用住宅扣抵稅額5萬元，經國稅局以甲君或其配偶、同一申報戶受扶養直系親屬於102年度均未在重購房屋辦竣戶籍登記，不符合所得稅法規定予以剔除，甲君不服，主張該重購房屋確實為自住，惟國稅局調閱戶籍資料，甲君重購之房屋102年度不符合自用住宅與所得稅法規定不合駁回在案。

特別呼籲，辦理當年度綜合所得稅結算申報時，納稅義務人如列報重購自用住宅扣抵稅額，應注意符合所得稅法相關法令規定，以免因不諳法令遭剔除補稅。