為提升電子化服務效能，落實政府節能減碳政策，營利事業所得稅申報調帳查核案件，除會計師簽證申報案件、機關或團體申報案件、決算申報案件及清算申報案件外，均可採用網路或媒體提示營利事業帳簿資料電子檔案。營利事業可至財政部電子申報繳稅服務網站（https：//tax.nat.gov.tw/）下載營利事業電子帳簿上傳系統，經審核營利事業基本資料表及帳簿資料電子檔無誤後，即可以網路上傳並列印收執聯，免送紙本帳簿，省時又省力。
公司組織之營利事業因孳息他益股權信託契約取得之股權孳息收益屬應稅收入，應計入所得額課徵營利事業所得稅。財政部於102年7月31日以台財稅字第10100238630號令核釋，公司組織之營利事業因孳息他益股權信託契約取得收益，實非其自行投資國內其他營利事業所獲配之股利淨額或盈餘淨額，無所得稅法第42條第1項不計入所得額課稅規定之適用，應計入所得額課徵營利事業所得稅。
營利事業出售乘人小客車，應以「售價」減除「依所得稅法規定正常折舊方法計算之未折減餘額」計算出售資產損益。依所得稅法第51條之1及營利事業所得稅查核準則第95條第13款至第15款規定，營利事業自93年1月1日起新購置之乘人小客車，依規定耐用年數計提折舊時，其實際成本以不超過新臺幣（以下同）250萬元為限；經營小客車租賃業務之營利事業，新購置之乘人小客車實際成本以不超過500萬元為限；超提之折舊額，不予認定；嗣後該乘人小客車於使用後出售時，其出售資產損益之計算，仍應以依所得稅法規定正常折舊方法計算之未折減餘額為基礎，而非以稅法規定之折舊限額計算未折減餘額。