依據所得稅法第17條第1項第2款第3目第5小目規定，納稅義務人申報扶養就讀大專以上院校子女的教育學費每人每年可扣除新臺幣(下同)25,000元，不滿25,000元者，以實際發生數為限。適用上述教育學費特別扣除額的受扶養親屬為「就讀大專以上院校」的「子女」，民眾常常誤解只要是「就學中」的扶養親屬皆可適用，導致日後補稅情況發生。常犯類型有：1.納稅義務人或配偶在職進修2.扶養就學中的兄弟姊妹或其他親屬。以上情況並不適用教育學費特別扣除額。
祭祀公業派下員為處理派下員確認之訴所獲得之報酬，應依規定申報綜合所得稅。依財政部80年1月18日台財稅第790687388號函規定，未辦財團法人登記之祭祀公業處分公業之土地，將其所得價款分配予各派下員所有時，准免納綜合所得稅。該函釋係針對派下員獲配之處分土地款，為公同共有人對公同共有土地之處分，依所得稅法第4條第1項第16款規定，該出售土地之交易所得免稅。但如其派下員為處理派下權確認之訴，而取得之報酬，則應依所得稅法第14條第1項第10類規定，以其收入額減除成本及必要費用後之餘額為所得額，列報其他所得，課徵綜合所得稅。
臺南市陳先生來電詢問：107年度綜合所得稅因為工作忙碌忘記在108年5月31日前辦理結算申報，現在補申報是否會被處罰?納稅義務人未於法定期間內申報綜合所得稅，只要在未經檢舉、未經稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查前，自動補報並補繳稅款者，即可適用稅捐稽徵法第48條之1規定，免予處罰。補繳之稅款，雖不加徵滯納金，但應自該項稅捐原繳納期限截止之次日起，至補繳之日止，就補繳之應納稅捐，依原應繳納稅款期間屆滿之日郵政儲金匯業局之1年期定期存款利率按日加計利息。以陳先生為例，只要其在未經檢舉或未經稽徵機關調查前自動補報並補繳稅款，僅需加計利息，並不會受罰及被加徵滯納金。