甲公司承攬社區大樓保全業務，每月收取服務費用新臺幣(下同)35萬元〔含人事薪資費用30萬元及行政管銷費用5萬元〕，甲公司僅就行政管銷費用5萬元開立發票，經國稅局查獲認定承攬期間短開發票約800萬元，補徵稅額40萬元，並處罰鍰60萬元。甲公司不服，主張所承攬社區大樓服務型態為顧問方式，合約書明確記載工作人員薪資費用每月30萬元，該公司僅代收轉付大樓保全人員薪資費用，不應列為收入。
保稅貨物盤虧補稅案件，其補徵之營業稅額，營業人不得列入扣抵銷項稅額，請營業人於申報營業稅時特別注意。貨物進口時，應徵之營業稅，由海關代徵。營業人得於繳納後，以海關代徵營業稅繳納證扣抵聯申報扣抵銷項稅額。惟依加值型及非加值型營業稅法施行細則第30條第2項第2款規定，保稅區營業人或海關管理之免稅商店、離島免稅購物商店辦理保稅貨物盤存，實際盤存數量少於帳面結存數量，經海關補徵之營業稅額，不可列入扣抵銷項稅額。海關核發之「海關進口貨物稅費繳納證兼匯款申請書」第二聯扣抵聯，亦加註提醒營業人不得列入扣抵。營業人若疏忽將不得扣抵進項申報扣抵銷項稅額，致有漏稅額，除追繳稅款外，將按漏稅額處5倍以下罰鍰。
上市櫃公司召開股東會的季節又到了，部分公司都會在股東會時發放股東紀念品，以表示對股東的感謝。依加值型及非加值型營業稅法第19條第1項第3款、同法施行細則第26條第1項及財政部87年12月3日台財稅第871976465號函釋規定，公司於召開股東會時，贈送股東之紀念品核屬與推展業務無關之餽贈，其進項稅額不得申報扣抵銷項稅額。進一步說明，部分營業人以其產製、進口、購買供銷售之貨物作為股東會紀念品，其所支付之進項稅額已申報扣扺銷項稅額者，應於轉作紀念品贈送股東時，依加值型及非加值型營業稅法第3條第3項第1款規定，視為銷售貨物，應按時價開立統一發票，買受人為營業人自己，惟自行開立之統一發票扣扺聯所載明之稅額，不得扣扺銷項稅額。