營利事業因出售土地而拆除地上房屋，該地上房屋之帳載未折減餘額，應視為土地出售成本。依財政部76年7月28日台財稅第7639482號函規定，營利事業出售其持有之土地，依合約約定地上房屋應清除騰空交付者，其因出售土地而拆除地上房屋，該地上房屋之帳面未折減餘額，應視為土地出售實際成本之一部分，基於收入與成本費用配合原則，於出售土地增益項下減除，合併計算損益。
綜合所得稅申報有關「醫藥及生育費」列舉扣除額係針對身心病痛接受治療而支付之醫療費用，屬生活中之必要支出，故於計算所得淨額時准予列舉扣除，是以納稅義務人檢附依法立案之公立單位，或與全民健康保險具有特約關係之護理之家機構及居家護理機構所出具之收據，該支出仍須符合「醫療行為」，始得列舉扣除。【舉例說明】納稅義務人甲君辦理107年度綜合所得稅結算申報，列報醫藥及生育費扣除額40餘萬元，國稅局以其中看護費20餘萬元不符合規定，予以剔除，補徵4萬餘元。甲君不服，主張因父親住院接受治療時，經醫生叮囑需有人全日陪伴，該看護費用確屬醫療行為支出，請准予核認云云，申請復查。案經該局以看護費核其性質為一般照顧費，駁回復查申請，未經提起訴願而告確定。
營業人承包工程因施工延誤，致發包人依工程合約對承包人處以罰款，承包人應按工程款開立發票報繳營業稅，不得以工程款抵付逾期罰款後之淨額開立統一發票。依加值型及非加值型營業稅法（以下簡稱營業稅法）第16條第1項規定，銷售額為營業人銷售貨物或勞務所收取之全部代價，包括營業人在貨物或勞務價額外收取之一切費用，並應依同法第32條第1項規定，依營業人開立銷售憑證時限表規定之時限，開立統一發票交付買受人。包作業承包工程，依「營業人開立銷售憑證時限表」規定，應依「工程合約所載每期應收價款時」開立統一發票，若發生逾期完工而被處罰款情事，依財政部75年7月26日台財稅第7555737號函規定，被處罰款與依限開立發票係屬二事，不得以工程款抵付逾期罰款而以淨額開立統一發票，仍應就承包工程原應收取之工程款開立統一發票。